Meyer explica que as estratégias de manejo recomendadas para essa doença são: a utilização de cultivares resistentes/tolerantes, o tratamento de sementes, a rotação/sucessão de culturas com milho e outras espécies de gramíneas e o controle químico com fungicidas. Além da soja, o pesquisador relata que o fungo, causador da doença, infecta mais de 400 espécies de plantas, entre elas importantes culturas como o algodão, o mamão, a seringueira, o tomate, o feijão, a crotalária e diversas plantas daninhas. Além disso, o fungo pode sobreviver em sementes infectadas e em restos de cultura e formar estruturas de sobrevivência.
A publicação Eficiência de fungicidas para o controle da mancha alvo, Corynespora cassiicola, na cultura da soja, na safra 2023/2024: resultados sumarizados dos ensaios cooperativos, traz um comparativo sobre a eficiência de fungicidas registrados e em fase de registro para o controle da mancha-alvo na cultura da soja. Os resultados vêm sendo gerados, desde a safra 2011/2012, por uma rede de pesquisa, formada por diferentes instituições brasileiras.